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本制品是一种用于实时荧光定量PCR，即qPCR或real-time PCR的高品质预混液，主要用于cDNA和基因组DNA等的特异性超高灵敏度定量检测。

本制品包含了ByFast Taq DNA Polymerase、PCR Buffer、dNTPs、SYBR Green I荧光染料、稳定剂和镁离子等所有的通用组分，使操作更简单、使用更便捷。用户只需自备引物、样品DNA和去离子水即可。

本制品使用SYBR Green I作为染料。SYBR Green I是一种结合于双链DNA(dsDNA)双螺旋小沟区域的绿色荧光染料。SYBR Green I在游离状态下的荧光比较微弱，一旦与双链DNA结合后，其荧光会大大增强。这样通过检测荧光强弱就可以定量检测PCR过程中扩增产生的双链DNA的数量。

本制品使用的ByFast Taq DNA Polymerase是一种与抗体结合的高品质热启动酶，能够实现便捷高效的热启动。ByFast Taq DNA Polymerase中的Taq酶与抗Taq酶的单克隆抗体相互结合，从而抑制了Taq酶的DNA聚合酶活性，这样可以有效避免在低温条件下由引物和模板DNA非特异性退火或引物二聚体引起的非特异性扩增。在PCR反应的预变性步骤中抗体会被加热失活，这样可以确保仅在预变性后才会把Taq酶的活性释放出来，预变性之前不会发生DNA聚合反应，从而大大提高了PCR反应的特异性、灵敏度和定量检测的准确性。

本制品有三个货号可选择，分别是不含ROX、含Low ROX和含High ROX。ROX的作用是用于校正与PCR无关的荧光波动，从而最大限度减少孔间差异。这种差异可能由多种因素引起，如移液误差及样品蒸发等。不同的荧光定量PCR仪对ROX的要求不同，请根据实际所用仪器选择相应的货号。通常含高浓度ROX的ByFast SYBR Green qPCR Mix也可以用于不需要ROX或需要低浓度ROX的荧光定量PCR仪。常用仪器所需ROX类型请参考如下表格。

货号	ROX类型	适用PCR仪
YTB4060	不含	Bio-Rad:CFX384,CFX96,MiniOpticon,iCycler IQ,MyiQ and iQ5; Eppendorf:Mastercycler ep realplex and realplex2 s; Qiagen/Corbett Rotor-Gene:6000; Roche:LightCycler 480;Cepheid:SmartCycler;Illumina:Eco qPCR
YTB4060L	Low ROX	ABI:7500(Fast),ViiA 7,QuantStudio 6 and 7 Flex Systems; Stratagene:Mx3000P,Mx3005P and Mx4000; Qiagen/Corbett Rotor-Gene:3000; Bio-Rad/MJ:Chromo4,Opticon 2 and Opticon
YTB4060H	High ROX	ABI GeneAmp 5700;ABI PRISM 7000,7700;ABI 7300,7900HT(Fast); ABI StepOne(Plus)

组分	1mL	5mL	25mL
2×ByFast SYBR Green qPCR Mix	1mL	5×1mL	25×1mL
说明书	1份

保存：-20℃，避光，有效期1年。


本制品如果用于常规的96孔板qPCR检测(建议反应体系为20μL)，每毫升 本制品可以进行100次检测；如果用于常规的384孔板qPCR检测(建议反应体系为10μL)，每毫升 本制品可以进行200次检测。

• 本制品尽量避免反复冻融，置于4℃避光保存，一个月内有效。
  
• 使用前需确保整管试剂完全融化，上下颠倒轻轻混匀后使用。混匀过程中尽量避免产生气泡。
  
• 注意引物退火温度，当退火温度<60℃时，推荐使用三步法PCR扩增。
  
• 本制品中含有SYBR Green I荧光染料，保存本制品或设置PCR反应时应避免强光照射，以尽量避免荧光淬灭问题。
  
• 对于超过350bp或者高GC含量的扩增片段，建议增加延伸时间至60秒或者采用三步法以提高扩增效率。
  
• 经测试，本制品反复冻融10次对使用效果无显著影响。但仍需尽量避免反复冻融本制品，反复冻融可能使产品性能下降。
  
• qPCR检测是超高灵敏度的检测，PCR反应设置区域需尽量避免各种可能的待扩增产物的污染。PCR产物宜密封后丢弃，以避免超高浓度的PCR产物污染实验环境。

以下举例为常规qPCR反应系统，仅供参考。实际反应条件因模板、引物等的结构不同而各异，需根据模板、引物、目的片段的特点设定最佳反应条件，并根据比例放大或缩小反应体系。

• PCR反应体系：
  
  • 融解并混匀PCR反应所需的各种溶液。2×ByFast SYBR Green qPCR Mix完全融解并混匀后置于冰浴上或冰盒内。
    
  • 参考下表在室温或冰浴上设置PCR反应体系(以96孔板为例)：
    

    成分	用量
    2×ByFast SYBR Green qPCR Mix	10μL
    Forward and Reverse Primer Mix (3μM each)	2μL
    Template DNA	2μL
    RNase-Free Water	6μL

    • 通常引物的终浓度为0.2～0.5μM时可获得良好的检测效果，也可根据情况在0.1～1.0μM范围内调整引物的终浓度。
      
    • 通常DNA模板的量以1～10ng cDNA或10～100ng基因组DNA为参考用量。因不同物种的模板中含有的目的基因拷贝数不同，如有必要，可对模板进行梯度稀释，以确定最佳的模板使用量。RT-PCR反应得到的cDNA直接作为模板时，其添加量不要超过PCR反应总体积的10%。
      
    • 96孔板的推荐反应体系为20μL，也可以根据实际实验需求，按比例扩大或缩小反应体系。
      
    • 建议设置不加模板的阴性对照组。
  • 用移液器轻轻吹打混匀或轻微Vortex混匀，室温离心数秒，使液体积聚于管底。
    
  • 将设置好的PCR反应管或PCR反应板置于荧光定量PCR仪上，开始PCR反应。
• PCR反应程序：
  在Real-time PCR反应前进行模板的预变性，通常设定为95℃ 2分钟，复杂或高GC模板适当延长时间至5分钟。本制品中的ByFast Taq DNA Polymerase可以在15秒内可完成至少300bp的扩增，可以满足绝大多数的qPCR实验；对于超过350bp或者高GC含量的扩增子，建议增加延伸时间至60秒或者采用三步法以提高扩增效率。建议采用如下的PCR程序，本程序是以ABI 7900HT荧光定量PCR仪为例：
  
  • 设置反应程序
    

    过程	温度	时间	循环数
    预变性	95℃	2min	1
    变性	95℃	15sec	1
    退火/延伸	60℃	15～30sec	40

  • 熔解曲线分析(可选)：95℃ 15sec,60℃ 15sec,95℃ 15sec
    
  • 使用荧光定量PCR仪提供的软件分析结果
  三步法只需在退火/延伸后加一步72℃ 30sec，40个循环即可。

• 荧光定量PCR结果不理想，出现特异性不好或扩增效率不高时，可能是由于以下原因造成：
  
  • 引物设计不佳。请选择适当的引物设计软件进行引物设计，注意引物的GC含量、二级结构、二聚体、退火温度、长度、特异性等方面的问题。也可以尝试使用有文献报道使用过的引物，或者从百奥莱博订购经过测试的qPCR引物。
    
  • 待扩增片段GC含量偏高。GC含量较高的情况下PCR会变得相对比较困难，此时宜更换引物。
    
  • PCR反应体系在室温设置时容易导致非特异性条带，但在使用热启动酶时可以有效避免室温操作导致的非特异性条带的产生。但对于一些较难扩增的产物，可以尝试在冰浴上设置PCR反应体系，以进一步减少非特异性的DNA扩增。
    
  • 退火温度不佳，需要优化。这种情况下宜更换引物。
    
  • 待扩增片段GC含量较高或长度较长，变性不够充分。此时宜更换引物，使待扩增片段的GC含量和长度适中。
    
  • 模板量太低，此时宜适当加大模板量。
    
  • 模板中含有抑制PCR反应的物质，可以用适当的DNA纯化方法例如柱纯化等纯化模板DNA。
• 反应条件优化方法：
  
  • 引物浓度：通常引物终浓度为0.2～0.5μM时可获得良好检测效果，终浓度可以在0.1～1.0μM范围内适当调整。如果希望提高反应特异性，可降低引物浓度；如果希望提高扩增效率，可增加引物的浓度，从而优化反应体系。
    
  • 退火温度：建议采用两步法PCR，退火温度60℃进行反应。如果希望提高反应特异性，可提高退火温度，以60～64℃作为退火温度的调整范围。在引物Tm值较低而得不到良好的实验结果时，可尝试进行三步法PCR扩增，三步法的退火温度请以56～64℃作为温度设置的参考范围。
    
  • 延伸时间：建议采用两步法PCR，延伸15～30秒。对于超过350bp或者高GC含量的扩增子，建议增加延伸时间至60秒或者采用三步法以提高扩增效率。

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